生物学分类是一种对生物物种进行分门别类的科学方法，用于区分不同种类的生物，并按照它们的亲缘关系和进化关系进行分类。以下是生物学分类中的域界门纲目科属种：
1. 域：是最高级别的分类层次，包括原核生物域、真核生物域和未分类的生物域。其中原核生物域包括细菌和古菌等，真核生物域则包括所有细胞中含有细胞耗生物，如植物、动物和真菌等。
2. 界：在域之下，分为动物界、植物界、真菌界等。这是基于生物体的形态、生理和遗传特征进行分类的。
3. 门：是界之下的分类级别，如动物界的脊椎动物门、无脊椎动物门等；植物界的种子植物门、裸子植物门等。这一级别的分类是基于更详细的生物特征。
4. 纲：是门的下一级分类，如哺乳纲、爬行纲等。在这一级别，生物的分类主要基于生殖方式、骨骼结构等特征。
5. 目：是纲的下一级分类，例如啮齿目、翼手目等动物，或者是菊目等植物类群。目的划分更关注物种的习性和生活方式等特征。
6. 科：是目的下一级分类，如猫科动物中的豹科等。科的划分基于物种之间的形态和遗传相似性。
7. 属：是科的下一级分类，同一属内的物种通常有较高的遗传相似性。例如猫科中的豹属包括狮子、老虎等。
8. 种：是最基本的分类单位，通常是指具有相同基因库的个体群。每个物种都有其独特的遗传信息和生活习性。在同一物种内，不同个体之间可以进行自然交配并产生可育后代。
综上所述，域界门纲目科属种构成了生物学的分类体系，用于描述和区分不同种类的生物。这种分类体系有助于科学家研究生物的进化关系、生态位以及与其他生物的关系等。
现代生物学普遍采用的 “三域系统”（threedomain system）由美国微生物学家 卡尔·沃斯（carl oese） 在1977年提出，基于 rRNA基因序列分析，将生命分为以下三个域：
1. 细菌域（bacteria）
典型的原核生物，细胞结构简单，无细胞核。
包括常见的致病菌（如大肠杆菌、链球菌）和有益菌（如乳酸菌）。
2. 古菌域（Archaea）
类似细菌的原核生物，但在基因和生化特性上更接近真核生物。
多生活在极端环境（如高温、高盐、强酸），如 嗜热菌、产甲烷菌。
3. 真核生物域（Eukarya）
具有真正的细胞核和复杂细胞结构。
包括 动物、植物、真菌、原生生物（如藻类、变形虫）。
补充明：
病毒 不属于三域系统，因为它们没有细胞结构，依赖宿主繁殖。
三域分类取代了传统的 “五界系统”（原核生物、原生生物、真菌、植物、动物），更符合分子生物学证据。
在生物分类学中，六界系统（Six Kingdoms）是在传统的 五界系统（原核生物界、原生生物界、真菌界、植物界、动物界）基础上，结合分子生物学研究进一步细化而来的分类方式。目前较为公认的 六界分类 如下：
1. 细菌界（bacteria）
原核生物，无细胞核，细胞壁含肽聚糖。
包括 大肠杆菌、蓝藻（蓝细菌）、乳酸菌、链球菌 等。
2. 古菌界（Archaea）
原核生物，但基因和代谢更接近真核生物。
适应极端环境，如 嗜热菌、产甲烷菌、嗜盐菌。
3. 原生生物界（protista）
真核生物，结构简单，多为单细胞或简单多细胞。
包括 藻类（如硅藻）、原生动物（如草履虫、变形虫）、黏菌。
4. 真菌界（Fungi）
真核生物，异养（吸收营养），细胞壁含几丁质。
包括 酵母、霉菌、蘑菇 等。
5. 植物界（plantae）
真核生物，自养（光合作用），细胞壁含纤维素。
包括 苔藓、蕨类、裸子植物（松树）、被子植物（开花植物）。
6. 动物界（Animalia）
真核生物，异养（摄食），无细胞壁，可运动。
包括 海绵、昆虫、鱼类、鸟类、哺乳动物（包括人类）。
补充明：
1. 六界 vs. 三域
三域系统（细菌、古菌、真核生物）是基于 分子进化 的高阶分类。
六界系统 是在 真核生物域 下进一步细分，适用于传统形态分类。
2. 病毒不属于任何界
病毒无细胞结构，依赖宿主繁殖，通常不被归入六界或三域。
3. 其他分类方案
有些学者提出 七界系统（如将 色藻界 chromista 独立出来）。
但 六界分类 仍是目前最广泛接受的中等阶元分类方式。
以下是 动物界（Animalia）所有已确认的门（约 34个），包括一些罕见或型门类，并附上简要特征和代表生物：
1. 后口动物（deuterostomia）
1. 脊索动物门（chordata）
脊椎动物（鱼、鸟、兽等）、尾索动物（海鞘）、头索动物（文昌鱼）。
2. 棘皮动物门（Echinodermata）
海星、海胆、海参（五辐射对称，水管系统）。
3. 半索动物门（hemichordata）
柱头虫（具口索，类似脊索动物但非真正脊索）。
2. 原口动物（protostomia）
（1）蜕皮动物（Ecdysozoa）
4. 节肢动物门（Arthropoda）
昆虫、蜘蛛、甲壳类（外骨骼，分节附肢）。
5. 线虫动物门（Nematoda）
蛔虫、钩虫（圆柱形，无分节）。
6. 线形动物门（Nematomorpha）
铁线虫（幼虫寄生，成虫自由生活）。
7. 有爪动物门（onychophora）
鹅绒虫（兼具环节和节肢动物特征）。
8. 缓步动物门（tardigrada）
水熊虫（极端环境生存）。
9. 动吻动物门（Kinorhyncha）
型海洋生物，体表分节。
10. 铠甲动物门（Loricifera）
深海微型动物，具外鞘。
11. 环口动物门（cycliophora）
仅1种（Symbion pandora），寄生龙虾口器。
（2）螺旋卵裂动物（Lophotrochozoa）
12. 软体动物门（mollusca）
蜗牛、章鱼、蛤蜊（多数有壳）。
13. 环节动物门（Annelida）
蚯蚓、水蛭（身体分节）。
14. 扁形动物门（platyhelminthes）
涡虫、绦虫（扁平无体腔）。
15. 纽形动物门（Nemertea）
纽虫（具长可伸缩的吻）。
16. 苔藓动物门（bryozoa）
群体滤食者，形似苔藓。
17. 腕足动物门（brachiopoda）
海豆芽（双壳但非软体动物）。
18. 内肛动物门（Entoprocta）
型水生生物，触手环绕肛门。
19. 外肛动物门（Ectoprocta）
与苔藓动物相似，现多归入苔藓动物门。
20. 微颚动物门（micrognathozoa）
仅1种（Limnognathia maerski），体长0.1mm。
21. 轮形动物门（Rotifera）
轮虫（具纤毛冠，淡水常见）。
22. 腹毛动物门（Gastrotricha）
微水生生物，腹部具纤毛。
23. 颚胃动物门（Gnathostomulida）
沙粒间生活的微型动物。
24. 星虫动物门（Sipuncula）
星虫（无分节，体腔发达）。
25. 螠虫动物门（Echiura）
螠虫（幼体分节，成虫不分节）。
3. 其他基础动物门
26. 刺胞动物门（cnidaria）
水母、珊瑚（刺细胞，辐射对称）。
27. 栉水母动物门（ctenophora）
栉水母（靠纤毛板运动，无刺细胞）。
28. 多孔动物门（porifera）
海绵（无组织，滤食）。
29. 扁盘动物门（placozoa）
仅1种（丝盘虫，最简单多细胞动物）。
30. 中生动物门（mesozoa）
二胚虫（寄生，极简结构）。
31. 菱形动物门（Rhombozoa）
头足类寄生虫，现多归入中生动物门。
32. 直泳动物门（orthonectida）
海洋寄生虫，体微。
33. 异涡动物门（xenacoelomorpha）
无肠目动物（无消化系统）。
34. 丝形动物门（Nectonematoida）
海洋浮游幼虫，成虫寄生甲壳类。
补充明
争议门类：部分门（如直泳动物、菱形动物）可能被归并到其他门。
新发现：深海和极端环境中可能仍有未描述的动物门。
病毒、原生生物：不属于动物界。
关键点总结
1.最大门：节肢动物门（昆虫、蜘蛛等）占绝对优势。
2.人类所属：脊索动物门 → 脊椎动物亚门 → 哺乳纲。
3.最原始：多孔动物（海绵）和扁盘动物（丝盘虫）结构最简单。
4.极端生存：缓步动物（水熊虫）可耐受太空、高温、辐射。
植物界（plantae）的全部门类列表 ：
植物界（plantae）包括所有光合自养的真核多细胞植物，从简单的苔藓到高等开花植物。根据现代系统分类，植物界可划分为 12个门（部分分类系统略有差异），按演化顺序排列如下：
1. 非维管植物（Nonvascular plants）
（1）苔藓植物门（bryophyta）
代表类群：苔藓（mosses）、泥炭藓（Sphagnum）
特征：无维管组织，依赖水环境繁殖，体型。
（2）地钱门（marchantiophyta）
代表类群：地钱（Liverorts）
特征：叶状体或叶状结构，无真正根茎叶。
（3）角苔门（Anthocerotophyta）
代表类群：角苔（hornorts）
特征：叶状体，孢子体具长角状结构。
2. 维管植物（Vascular plants）
（4）石松门（Lycopodiophyta）
代表类群：石松（clubmosses）、卷柏（Selaginella）
特征：型维管植物，叶为微叶（microphylls）。
（5）木贼门（Equisetophyta）
代表类群：木贼（horsetails）
特征：茎具节，叶退化成鳞片状。
（6）真蕨门（polypodiophyta）
代表类群：蕨类（Ferns）、树蕨（tree ferns）
特征：大型羽状复叶，靠孢子繁殖。
（7）松柏门（pinophyta，裸子植物 Gymnosperms）
代表类群：松树（pines）、银杏（Ginkgo）、苏铁（cycads）
特征：种子裸露，无真正花和果实。
（8）买麻藤门（Gnetophyta）
代表类群：麻黄（Ephedra）、买麻藤（Gnetum）
特征：裸子植物中较进化，部分具类似花的结构。
（9）被子植物门（magnoliophyta，Angiosperms）
代表类群：所有开花植物（玫瑰、麦、橡树等）
特征：种子包裹在果实内，具真正的花。
3. 已灭绝或争议的植物门
（10）前裸子植物门（progymnospermophyta）?
代表类群：Archaeopteris（已灭绝）
特征：介于蕨类和裸子植物之间的过渡类群。
（11）莱尼蕨门（Rhyniophyta）?
代表类群：莱尼蕨（Rhynia，最早维管植物之一）
特征：无根无叶，仅具简单分枝茎。
（12）三裂蕨门（trimerophytophyta）?
代表类群：三裂蕨（trimerophyton）
特征：早期维管植物，可能演化为现代蕨类和种子植物。
总结
| 分类 | 门名（中文\/拉丁名） | 代表生物 | 现存\/灭绝 |
| 非维管植物 | 苔藓植物门（bryophyta） | 苔藓 | 现存 |
| | 地钱门（marchantiophyta） | 地钱 | 现存 |
| | 角苔门（Anthocerotophyta） | 角苔 | 现存 |
| 维管植物 | 石松门（Lycopodiophyta） | 石松 | 现存 |
| | 木贼门（Equisetophyta） | 木贼 | 现存 |
| | 真蕨门（polypodiophyta） | 蕨类 | 现存 |
| | 松柏门（pinophyta） | 松树、银杏 | 现存 |
| | 买麻藤门（Gnetophyta） | 麻黄 | 现存 |
| | 被子植物门（magnoliophyta） | 开花植物 | 现存 |
| 已灭绝 | 前裸子植物门（progymnospermophyta） | Archaeopteris | 灭绝 |
| | 莱尼蕨门（Rhyniophyta） | 莱尼蕨 | 灭绝 |
| | 三裂蕨门（trimerophytophyta） | 三裂蕨 | 灭绝 |
关键点
1. 现存植物主要分9个门，其中 苔藓、蕨类、裸子植物、被子植物 是最重要的四大类群。
2. 被子植物（开花植物）占现存植物90%以上，是现今最繁盛的类群。
3. 已灭绝的3个门 对理解植物演化至关重要（如莱尼蕨是最早的维管植物之一）。
原生生物界（protista）全部门类详表：
原生生物界包含所有不属于动物、植物或真菌的真核生物，目前根据最新系统分类学研究（Adl et al., 2019等），可划分为 45个门（含部分争议类群）。以下是完整列表，按主要类群划分：
一、SAR超群（Stramenopiles+Alveolata+Rhizaria）
1. 不等鞭毛门（Stramenopiles\/ochrophyta）
硅藻纲（bacillariophyceae）
褐藻纲（phaeophyceae）
黄藻纲（xanthophyceae）
2. 囊泡虫门（Alveolata）
甲藻亚门（dinoflagellata）
顶复亚门（Apiplexa）
纤毛虫亚门（ciliophora）
3. 有孔虫门（Foraminifera）
4. 放射虫门（Radiolaria）
5. 丝足虫门（cercozoa）
二、古虫界（Excavata）
6. 眼虫门（Euglenozoa）
眼虫纲（Euglenida）
动质体纲（Kinetoplastida）
7. 后滴门（metamonada）
双滴虫纲（diplomonadida）
毛滴虫纲（trichomonadida）
8. 副基体门（parabasalia）
9. 异鞭毛门（heterolobosea）
10. 贾第虫门（Giardiidae）
三、变形虫类（Amoebozoa）
11. 裸变形虫门（tubulinea）
12. 绒变形虫门（Flabellinea）
13. 锥足虫门（conosa）
14. 黏菌门（mycetozoa）
原柱黏菌纲（protosteliida）
网柱黏菌纲（dictyosteliida）
四、原生藻类（Archaeplastida基础类群）
15. 灰藻门（Glaucophyta）
16. 红藻门（Rhodophyta）原始单细胞类群
五、opisthokonta基础类群
17. 领鞭毛虫门（choanoflagellata）
18. 核形虫门（Nucleariida）
19. 鱼孢菌门（Ichthyosporea）
六、cRum类群（尚无统一中文名，暂用拉丁名）
20. mantamonas门（曼塔虫门？未标准化）
21. Rigifilida门（硬丝虫门？未标准化）
22. cRum未知门（cRum为缩写，无正式译名）
七、其他重要门类
23. 定鞭藻门（haptophyta）
24. 隐藻门（cryptophyta）
25. picozoa门（皮科虫门，最原生生物）
26. Ancyromonadida门（锚滴虫门）
27. malaimonadida门（马拉维滴虫门）
28. hemimastigophora门（半鞭毛虫门）
29. telonemia门（端鞭虫门）
30. pansomonadida门（泛单鞭虫门）
31. Apusomonadida门（无足虫门）
32. Ancoracysta门（锚囊虫门）
33. breviatea门（短命虫门）
34. collodictyon门（网鞭虫门）
35. palpitomonas门（颤滴虫门）
36. microhelida门（太阳虫门）
37. provora门（掠食虫门，2022年新发现）
38. placidozoa门（平底虫门）
39. discoba总门下的tsukubamonas门（筑波虫门）
40. Neolouka门（新卢卡虫门）
41. podiata总门下的Varisulca门（变足虫门）
42. percolozoa门（穿孔虫门）
明
1. 译名规则：
已有广泛使用的中文名（如眼虫门、甲藻门）直接采用；
新分类群（如provora）按拉丁词根意译（如provora掠食虫门）；
极冷门类群保留拉丁名，标注未标准化。
2. 分类变动：
cRum类群（mantamonas等）因研究较少，中文名尚未统一；
部分门类（如picozoa）需根据后续研究调整译名。
分类特征总结
| 类群 | 代表门类 | 典型特征 | 生态角色 |
| SAR超群 | 硅藻门、甲藻门 | 复杂细胞结构 | 海洋初级生产者 |
| 古虫界 | 眼虫门、后滴门 | 特殊鞭毛结构 | 寄生\/自由生活 |
| 变形虫类 | 黏菌门 | 伪足运动 | 分解有机物 |
| 藻型原生生物 | 隐藻门 | 双重色素系统 | 淡水生态系统 |
| 微门类 | picozoa门 | ＜3微米体型 | 新发现类群 |
特别明
1. 系统学争议：部分门类（如微孢子虫）在不同系统中可能被归入真菌界
2. 新门类发现：provora（2022年命名）等新门仍在研究中
3. 生态多样性：包含地球上80%的真核生物多样性
如需具体门类的显微结构图或分子生物学特征，可提供更详细资料！
真菌界（Fungi）的全部门类列表 ：
真菌界（Fungi）是一类真核生物，包括酵母、霉菌、蘑菇等，主要营腐生、寄生或共生生活。目前真菌界被划分为 9个门（部分分类系统可能调整至11门），按演化关系排列如下：
1. 基础真菌（早期分支）
（1）微孢子虫门（microsporidia）
代表类群：微孢子虫（如 Encephalitozoon）
特征：专性细胞内寄生虫，极简化结构，无线粒体。
（2）隐真菌门（cryptomycota \/ Rozellomycota）
代表类群：Rozella（寄生其他真菌）
特征：无细胞壁，寄生生活方式。
2. 壶菌及相关类群
（3）壶菌门（chytridiomycota）
代表类群：壶菌（如 batrachochytrium dendrobatidis，导致蛙类壶菌病）
特征：具鞭毛的游动孢子，水生或土壤腐生。
（4）新美鞭菌门（Neocallimastigomycota）
代表类群：厌氧真菌（如 Neocallimastix，生活在反刍动物瘤胃）
特征：无氧环境生存，多鞭毛孢子。
3. 接合菌类（Zygomycota及相关类群）
（5）接合菌门（Zygomycota，狭义）
代表类群：根霉（Rhizopus，常见于腐烂水果）、毛霉（mucor）
特征：无隔菌丝，通过接合孢子繁殖。
（6）球囊菌门（Glomeromycota）
代表类群：丛枝菌根真菌（如 Glomus）
特征：与植物根系共生（形成菌根），无性繁殖。
4. 高等真菌（dikarya）
（7）子囊菌门（Asycota）
代表类群：酵母（Saccharomyces）、青霉（penicillium）、羊肚菌（morchella）
特征：有性生殖产生子囊孢子（如“蘑菇”中的子囊盘）。
（8）担子菌门（basidiomycota）
代表类群：蘑菇（Agaricus）、木耳（Auricularia）、锈菌（puccinia）
特征：有性生殖产生担孢子（典型“蘑菇”结构）。
5. 争议或门类
（9）芽枝霉门（blastocladiomycota）
代表类群：Allomyces（水生真菌）
特征：类似壶菌，但生活史复杂，有交替世代。
（10）虫霉门（Entomophthoromycota）
代表类群：Entomophthora（昆虫寄生真菌）
特征：寄生昆虫，孢子主动弹射传播。
（11）单毛菌门（monoblepharidiomycota）
代表类群：monoblepharis（罕见水生真菌）
特征：具鞭毛的游动配子，演化地位古老。
总结表
| 分类 | 门名（中文\/拉丁名） | 代表生物 | 主要特征 |
| 基础真菌 | 微孢子虫门（microsporidia） | 微孢子虫 | 细胞内寄生，无线粒体 |
| | 隐真菌门（cryptomycota） | Rozella | 无细胞壁，寄生真菌 |
| 壶菌类 | 壶菌门（chytridiomycota） | 蛙壶菌 | 具鞭毛孢子 |
| | 新美鞭菌门（Neocallimastigomycota） | 瘤胃真菌 | 厌氧，多鞭毛 |
| 接合菌类 | 接合菌门（Zygomycota） | 根霉、毛霉 | 接合孢子，无隔菌丝 |
| | 球囊菌门（Glomeromycota） | 丛枝菌根真菌 | 植物共生，无性繁殖 |
| 高等真菌 | 子囊菌门（Asycota） | 酵母、青霉 | 子囊孢子 |
| | 担子菌门（basidiomycota） | 蘑菇、锈菌 | 担孢子 |
| 其他门 | 芽枝霉门（blastocladiomycota） | Allomyces | 交替世代 |
| | 虫霉门（Entomophthoromycota） | 虫霉 | 寄生昆虫 |
| | 单毛菌门（monoblepharidiomycota） | monoblepharis | 游动配子 |
关键点
1. 子囊菌和担子菌是最大的两个门，占已知真菌物种的 90%以上（如蘑菇、霉菌、酵母）。
2. 微孢子虫和隐真菌是最原始的分支，结构高度简化。
3. 接合菌门（狭义）已拆分，部分类群独立为球囊菌门等。
4. 壶菌类（如蛙壶菌）对生态和疾病有重要影响。
真菌分类仍在更新中，部分门类（如隐真菌）的归属可能存在争议。
细菌界（bacteria）全部门类详表 ：
细菌界（bacteria）是原核生物的主要类群，根据基因组系统发育（如Gtdb、NcbI分类）划分为 约 70个门（部分门类仍在研究中）。以下是目前公认的所有细菌门类，包括主要门和型门（不略），按系统发育关系分类。
1. 主要细菌门类（广为人知的门）
| 门名（中文\/拉丁名） | 代表类群 | 特征 |
| 变形菌门（proteobacteria） | 大肠杆菌（Escherichia coli）、沙门氏菌（Salmonella） | 革兰氏阴性，分为a\/β\/γ\/δ\/e五类 |
| 厚壁菌门（Firmicutes） | 葡萄球菌（Staphylococcus）、乳酸菌（Lactobacillus） | 革兰氏阳性，部分形成芽孢 |
| 放线菌门（Actinobacteria） | 链霉菌（Streptomyces）、结核杆菌（mycobacterium） | 革兰氏阳性，高Gc含量 |
| 拟杆菌门（bacteroidetes） | 拟杆菌（bacteroides） | 肠道共生菌，降解多糖 |
| 蓝菌门（cyanobacteria） | 蓝藻（Synechococcus） | 光合作用，产氧气 |
| 衣原体门（chlamydiae） | 沙眼衣原体（chlamydia trachomatis） | 专性细胞内寄生 |
| 螺旋体门（Spirochaetes） | 梅毒螺旋体（treponema pallidum） | 螺旋形，运动性强 |
| 酸杆菌门（Acidobacteria） | 土壤酸杆菌 | 常见于酸性环境 |
| 绿弯菌门（chloroflexi） | 绿非硫细菌 | 光合或化能自养 |
| 浮霉菌门（planctomycetes） | planctomyces | 细胞结构特殊，有假核 |
2. 其他型细菌门（不略）
（1）常见但研究较少的门
11. 装甲菌门（Armatimonadetes）
12. 钙杆菌门（caldiserica）
13. 黏胶球形菌门（Elusimicrobia）
14. 纤维杆菌门（Fibrobacteres）
15. 芽单胞菌门（Gemmatimonadetes）
16. 硝化螺旋菌门（Nitrospirae）
17. 热袍菌门（thermotogae）
18. 脱铁杆菌门（deferribacteres）
19. 热脱硫杆菌门（thermodesulfobacteria）
20. 异常球菌栖热菌门（deinococcusthermus）
（2）极端环境或新发现的细菌门
21. 泉古菌门（Aquificae）
22. 热石菌门（thermodesulfobacteriota）
23. 热丝菌门（thermosulfidibacter）
24. 热厌氧杆菌门（thermoanaerobacterales）
25. 盐杆菌门（halobacteria）
26. 甲烷微菌门（methanomicrobia）
27. 厌氧氨氧化菌门（Anammox bacteria）
28. 黏球菌门（myxococcota）
29. 脱硫弧菌门（desulfobacterota）
30. 硫还原菌门（Syntrophobacteria）
（3）未培养或基因组推测的门（候选门）
31. 候选门oR3（candidate division oR3）
32. 候选门od1（candidate division od1）
33. 候选门SR1（candidate division SR1）
34. 候选门tm7（candidate division tm7）
35. 候选门op3（candidate division op3）
36. 候选门S6（candidate division S6）
37. 候选门bRc1（candidate division bRc1）
38. 候选门GAL15（candidate division GAL15）
39. 候选门patescibacteria（超细菌门）
40. 候选门margulisbacteria
3. 特殊功能类群（按生态\/代谢类型）
| 功能类型 | 代表门类 | 生态作用 |
| 光合细菌 | 蓝菌门、绿弯菌门 | 产氧\/不产氧光合作用 |
| 甲烷菌 | 甲烷微菌门 | 产甲烷，厌氧环境 |
| 硫酸盐还原菌 | 脱硫弧菌门 | 硫循环重要参与者 |
| 病原菌 | 衣原体门、螺旋体门 | 人类\/动物致病菌 |
| 未培养类群 | 候选门（tm7等） | 占微生物组大部分 |
总结
1. 细菌界目前分为70+门，包括：
主要门（如变形菌门、厚壁菌门）
型门（如装甲菌门、黏胶球形菌门）
候选门（未纯培养，仅通过dNA检测）
2. 分类标准：基于16S rRNA基因或全基因组系统发育（如Gtdb数据库）。
3. 新门类不断发现，尤其是深海、极端环境中的微生物。
古菌界（Archaea）全部门类详表 ：
古菌（Archaea）是与细菌、真核生物并列的第三大生命域，主要生活在极端环境（如高温、高盐、强酸）。根据最新分类系统（Gtdb, 2023），古菌界分为 约 30 个门（含候选门）。以下是完整列表，按主要类群划分：
1. 主要古菌门（经典分类）
| 门名（中文\/拉丁名） | 代表类群 | 特征 | 典型生境 |
| 广古菌门（Euryarchaeota） | 甲烷菌（methanogens）、嗜盐菌（halobacteria） | 代谢多样，包括产甲烷菌 | 湿地、肠道、盐湖 |
| 泉古菌门（crenarchaeota） | 硫化叶菌（Sulfolobus） | 超嗜热、嗜酸 | 热泉、深海热液 |
| 奇古菌门（thaumarchaeota） | 氨氧化古菌（Nitrososphaera） | 参与氮循环 | 海洋、土壤 |
| 阿斯加德古菌门（Asgardarchaeota） | Lokiarchaeota、thorarchaeota | 最接近真核生物祖先 | 深海沉积物 |
| 纳古菌门（Nanoarchaeota） | Nanoarchaeum equitans | 超型（~400 nm），寄生 | 依附其他古菌 |
2. 其他型古菌门（不略）
（1）已确认门类
6. 初古菌门（Korarchaeota）
7. 曙古菌门（Aigarchaeota）
8. 武尔卡尼古菌门（Vulcanarchaeota）
9. 赫尔墨斯古菌门（hermodarchaeota）
10. 巴尔德古菌门（baldrarchaeota）
11. 奥丁古菌门（odinarchaeota）
12. 海姆达尔古菌门（heimdallarchaeota）
13. 热原体门（thermoplasmata）
14. 甲烷火菌门（methanopyri）
15. 热球菌门（thermococci）
（2）候选门（未纯培养）
16. 候选门Altiarchaeota
17. 候选门diapherotrites
18. 候选门Iainarchaeota
19. 候选门micrarchaeota
20. 候选门parvarchaeota
21. 候选门pacearchaeota
22. 候选门oesearchaeota
23. 候选门huberarchaeota
24. 候选门methanomethylicia
25. 候选门Nezhaarchaeota
3. 按生态功能分类
| 功能类型 | 代表门类 | 作用 |
| 产甲烷菌 | 广古菌门（部分） | 厌氧环境产甲烷 |
| 嗜热菌 | 泉古菌门、武尔卡尼古菌门 | 生存于80°c+高温 |
| 嗜盐菌 | 广古菌门（halobacteria） | 高盐环境（如死海） |
| 氨氧化菌 | 奇古菌门 | 全球氮循环关键角色 |
| 寄生\/共生菌 | 纳古菌门 | 依赖宿主生存 |
总结
1. 古菌界目前分为约30个门，包括：
经典门类（如广古菌门、泉古菌门）
新发现门类（如阿斯加德古菌门）
候选门（仅通过宏基因组检测）
2. 分类依据：基于16S rRNA基因及全基因组系统发育（Gtdb）。
3. 研究热点：阿斯加德古菌与真核生物起源的关系。
结构有些复杂，脑子有些胀，今就到这